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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Corte. |
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Data corrente: |
27/12/2019 |
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Data da última atualização: |
27/12/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
MATIAS, F. I.; VIDOTTI, M. S.; MEIRELES, K. G. X.; BARRIOS, S. C. L.; VALLE, C. B. do; CARLEY, C. A. S.; FRITSCHE-NETO, R. |
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Afiliação: |
Filipe Inácio Matias, Universidade de São Paulo - USP/Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz" - ESALQ/Departamento de Genética; Miriam Suzane Vidotti, Universidade de São Paulo - USP/Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz" - ESALQ/Departamento de Genética; KAREM GUIMARAES XAVIER MEIRELES, CNPGC; SANZIO CARVALHO LIMA BARRIOS, CNPGC; Cacilda Borges do Valle, Colaboradora da Embrapa Gado de Corte; Cari A. Schmitz Carley; Roberto Fritsche-Neto, Universidade de São Paulo - USP/Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz" - ESALQ/Departamento de GenéticaUniversidade de São Paulo - USP/Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz" - ESALQ/Departamento de Genética. |
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Título: |
Association Mapping Considering Allele Dosage: An Example of Forage Traits in an Interspecific Segmental Allotetraploid Urochloa spp. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Crop Science, v. 59, n. 5, p. 2062-2076, september-october, 2019. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The breeding process in tropical segmental allopolyploid forage Urochloa is challenging due to the complex genetic control of the traits. Knowledge about genes associated with forage traits, expressed in the different cutting seasons, are extremely useful to support breeding programs and development of new cultivars. Thus, the aims of our study were (i) to identify genomic regions related to forage traits through genomewide association studies (GWAS), and (ii) to verify the influence of allele dosage on these results. A panel of 272 genotypes of Urochloa spp. [U. brizantha (Hoscht. ex A. Rich.) R. Webster ´ U. ruziziensis (Hoscht. ex A. Rich.) R. Webster] was evaluated in both the wet and dry seasons. The GWAS analyses were performed with 26,535 single nucleotide polymorphisms (SNPs) obtained by genotyping-by-sequencing (GBS) using diploid and tetraploid allele dosage configurations. Furthermore, we evaluated scenarios including additive, dominance, and epistatic effects. Seven candidate genomic regions associated with the main forage traits of Urochloa spp. were identified. The importance of the diploid and tetraploid molecular configuration in GWAS analyses for segmental allopolyploid species was demonstrated to identify the genomic behavior of important regions. Results demonstrated that it is possible to identify the same regions using both ploidy configurations; however, in some cases, the allele substitution effect can be biased mainly for regions with dominance and epistatic effects. Finally, this study contributes to the understanding of genetic control of tropical forage traits and genomics to accelerate the selection and reduce the cost to release new cultivars. MenosThe breeding process in tropical segmental allopolyploid forage Urochloa is challenging due to the complex genetic control of the traits. Knowledge about genes associated with forage traits, expressed in the different cutting seasons, are extremely useful to support breeding programs and development of new cultivars. Thus, the aims of our study were (i) to identify genomic regions related to forage traits through genomewide association studies (GWAS), and (ii) to verify the influence of allele dosage on these results. A panel of 272 genotypes of Urochloa spp. [U. brizantha (Hoscht. ex A. Rich.) R. Webster ´ U. ruziziensis (Hoscht. ex A. Rich.) R. Webster] was evaluated in both the wet and dry seasons. The GWAS analyses were performed with 26,535 single nucleotide polymorphisms (SNPs) obtained by genotyping-by-sequencing (GBS) using diploid and tetraploid allele dosage configurations. Furthermore, we evaluated scenarios including additive, dominance, and epistatic effects. Seven candidate genomic regions associated with the main forage traits of Urochloa spp. were identified. The importance of the diploid and tetraploid molecular configuration in GWAS analyses for segmental allopolyploid species was demonstrated to identify the genomic behavior of important regions. Results demonstrated that it is possible to identify the same regions using both ploidy configurations; however, in some cases, the allele substitution effect can be biased mainly for regions with dominance and ep... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Tropical regions. |
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Thesaurus Nal: |
Animal performance; Animal proteins; Cattle feeding; Forage; Pastures; Urochloa. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/207880/1/Association-mapping-considering-Allele-dosage.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Gado de Corte (CNPGC) |
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Biblioteca |
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Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Solos. Para informações adicionais entre em contato com cnps.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Solos. |
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Data corrente: |
16/03/2012 |
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Data da última atualização: |
05/11/2012 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
ROCHA JUNIOR, P. R. R. da; DONAGEMMA, G. K.; ANDRADE, F. V.; PASSOS, R. R.; SYLVIO, A. |
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Afiliação: |
Paulo Roberto da Rocha Jr.; GUILHERME KANGUSSU DONAGEMMA, CNPS; Felipe Vaz Andrade; Renato Ribeiro Passos; Alexandre Sylvio. |
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Título: |
Avaliação dos atributos físicos e químicos de um argissolo vermelho sob pastagens e capoeira. |
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Ano de publicação: |
2011 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 33., 2011, Uberlândia, MG. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
As atividades antrópicas resultam em geral em perturbações e redução da sustentabilidade da exploração agrícola. Estima-se que no Brasil há mais de 200 milhões de ha degradados. Ações como métodos agropecuários inadequados resultam em impacto direto sobre a fertilidade do solo acarretando em posterior degradação dos solos. A compreensão e a quantificação dos impactos nos atributos físicos e químicos dos solos são de fundamental importância para a conservação e manutenção da produtividade das áreas agrícolas. Diante do exposto este trabalho teve como objetivo avaliar os atributos de um Argissolo Vermelho sob duas pastagens em estádio inicial de degradação e uma área de capoeira com seis anos em regeneração. Foram determinados os teores de carbono orgânico total, delta pH, estabilidade de agregados e posterior calculo do diâmetro médio geométrico e diâmetro médio ponderado. Os valores de delta pH para as áreas em estudo mostraram que ambas as áreas apresentaram cargas liquidas negativas, e não apresentaram diferença estatística na camada superficial, os valores de DMP e DMG foram estatisticamente iguais nas camadas superficiais, entretanto os valores de carbono orgânico total indicaram uma tendência a um estádio inicial de degradação dos solos na área de pasto1, podendo este fato estar relacionado com as atividades antrópicas nesta área. Dentre as analises realizadas o carbono orgânico total mostrou-se mais sensível as alterações no solo indicando um estádio inicial de degradação na área de Pasto 1. O uso agrícola das terras altera normalmente as propriedades do solo, dependendo das condições edáfoclimáticas. Dessa forma, diferentes sistemas de manejo resultam em impacto direto sobre os atributos do solo, que podem em alguns casos, prejudicar a conservação desse recurso natural e reduzir a produtividade das culturas (Reinert, 1998). O Brasil possui atualmente cerca 42% de sua superfície coberta por florestas nativas densas, 7% por florestas naturais abertas e 17% por outras formas de vegetação (Correa, 2005). Excluindo as áreas sob vegetação natural no Brasil, estima-se que há mais de 200 milhões de ha degradados (IBGE, 2006). Ações como métodos agropecuários inadequados resultam em impacto direto sobre a fertilidade do solo acarretando em posterior degradação dos solos. Extensas áreas degradadas estão relacionadas a pastagens mal manejadas que em geral apresentam algumas limitações quanto à fertilidade, elevada acidez e pedregosidade. A compreensão e a quantificação dos impactos dos atributos dos solos sob pastagens são de fundamental importância para a conservação e manutenção da produtividade dos solos. Diante deste cenário o presente estudo teve como objetivo, avaliar mudanças em alguns atributos físicos e químicos de um Argissolo Vermelho sob duas pastagens em estádio inicial de degradação e uma área de capoeira com seis anos de regeneração. MenosAs atividades antrópicas resultam em geral em perturbações e redução da sustentabilidade da exploração agrícola. Estima-se que no Brasil há mais de 200 milhões de ha degradados. Ações como métodos agropecuários inadequados resultam em impacto direto sobre a fertilidade do solo acarretando em posterior degradação dos solos. A compreensão e a quantificação dos impactos nos atributos físicos e químicos dos solos são de fundamental importância para a conservação e manutenção da produtividade das áreas agrícolas. Diante do exposto este trabalho teve como objetivo avaliar os atributos de um Argissolo Vermelho sob duas pastagens em estádio inicial de degradação e uma área de capoeira com seis anos em regeneração. Foram determinados os teores de carbono orgânico total, delta pH, estabilidade de agregados e posterior calculo do diâmetro médio geométrico e diâmetro médio ponderado. Os valores de delta pH para as áreas em estudo mostraram que ambas as áreas apresentaram cargas liquidas negativas, e não apresentaram diferença estatística na camada superficial, os valores de DMP e DMG foram estatisticamente iguais nas camadas superficiais, entretanto os valores de carbono orgânico total indicaram uma tendência a um estádio inicial de degradação dos solos na área de pasto1, podendo este fato estar relacionado com as atividades antrópicas nesta área. Dentre as analises realizadas o carbono orgânico total mostrou-se mais sensível as alterações no solo indicando um estádio inicial de degrada... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Argissolo vermelho; Carbono orgânico total; Degradação de pastagens; Estabilidade de agregados. |
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Thesagro: |
Capoeira. |
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Categoria do assunto: |
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
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Marc: |
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520 $aAs atividades antrópicas resultam em geral em perturbações e redução da sustentabilidade da exploração agrícola. Estima-se que no Brasil há mais de 200 milhões de ha degradados. Ações como métodos agropecuários inadequados resultam em impacto direto sobre a fertilidade do solo acarretando em posterior degradação dos solos. A compreensão e a quantificação dos impactos nos atributos físicos e químicos dos solos são de fundamental importância para a conservação e manutenção da produtividade das áreas agrícolas. Diante do exposto este trabalho teve como objetivo avaliar os atributos de um Argissolo Vermelho sob duas pastagens em estádio inicial de degradação e uma área de capoeira com seis anos em regeneração. Foram determinados os teores de carbono orgânico total, delta pH, estabilidade de agregados e posterior calculo do diâmetro médio geométrico e diâmetro médio ponderado. Os valores de delta pH para as áreas em estudo mostraram que ambas as áreas apresentaram cargas liquidas negativas, e não apresentaram diferença estatística na camada superficial, os valores de DMP e DMG foram estatisticamente iguais nas camadas superficiais, entretanto os valores de carbono orgânico total indicaram uma tendência a um estádio inicial de degradação dos solos na área de pasto1, podendo este fato estar relacionado com as atividades antrópicas nesta área. Dentre as analises realizadas o carbono orgânico total mostrou-se mais sensível as alterações no solo indicando um estádio inicial de degradação na área de Pasto 1. O uso agrícola das terras altera normalmente as propriedades do solo, dependendo das condições edáfoclimáticas. Dessa forma, diferentes sistemas de manejo resultam em impacto direto sobre os atributos do solo, que podem em alguns casos, prejudicar a conservação desse recurso natural e reduzir a produtividade das culturas (Reinert, 1998). O Brasil possui atualmente cerca 42% de sua superfície coberta por florestas nativas densas, 7% por florestas naturais abertas e 17% por outras formas de vegetação (Correa, 2005). Excluindo as áreas sob vegetação natural no Brasil, estima-se que há mais de 200 milhões de ha degradados (IBGE, 2006). Ações como métodos agropecuários inadequados resultam em impacto direto sobre a fertilidade do solo acarretando em posterior degradação dos solos. Extensas áreas degradadas estão relacionadas a pastagens mal manejadas que em geral apresentam algumas limitações quanto à fertilidade, elevada acidez e pedregosidade. A compreensão e a quantificação dos impactos dos atributos dos solos sob pastagens são de fundamental importância para a conservação e manutenção da produtividade dos solos. Diante deste cenário o presente estudo teve como objetivo, avaliar mudanças em alguns atributos físicos e químicos de um Argissolo Vermelho sob duas pastagens em estádio inicial de degradação e uma área de capoeira com seis anos de regeneração.
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